Badanie bakteriologiczne polega na pobraniu wymazu z rany. Wykonywane jest w przypadku podejrzenia infekcji bakteryjnych. Na 4 godziny przed pobraniem nie należy stosować środków bakteriostatycznych, dezynfekcji  i przepłukiwania rany. Zabieg ten jest zalecany osobom z przewlekłym stanem zapalnym przy wrastających paznokciach. Na podstawie wyniku dobiera się odpowiednią metodę leczenia i skuteczną antybiotykoterapię.